朱由检反问：“不挂牌，将来他来挂朕的头颅？”
果不其然，东林党又借此大做文章。
钱谦益上疏：“以贼统海，以番为藩，莫非朝纲尽弃？”
黄道周冷笑：“今之郑芝龙、顺化王，皆非明法所容，陛下若因利益暂容，将来如何收场？”
朱由检不怒，批示只一句：“朝纲不是念出来的，是打出来的。”
左光斗又上折批评郑芝龙专权，“恐有异志”。
朱由检让工部将“红夷二型火炮”布署于泉州港两侧，派魏忠贤亲巡视，并公示：“若有异志，先打沉他家的船。”
自此，朝堂虽议论不绝，但无人能动摇水师重建之策。
嘉平八年春，顺化王国首度遣使，抵达泉州，献上金珠、香料、沉香等奇货，奉表称臣。
朱由检接表，敕封其为“南洋顺化王”，赐大明铜印、册书、金册，并特允其自号“建文遗脉”。
至此，大明首次正式册封海外政权，并设“南洋事务厅”于礼部，处理番邦贡道事务。
郑芝龙回朝述职，朱由检赐宴于乾清宫，并当众道：“昔年郑芝龙为贼，今日为将，护国安海。能者为帅，天下得安。”
此言一出，文武皆无话可说。
嘉平八年终，户部总结当年国库收入达二千四百万两，远超往年。
市舶司、通洋司上缴海税合计三百万两，占国库总额超过一成。
南洋通道打通，东南沿海兴盛，泉州、厦门港船舶日夜不息，泉州新城扩至两倍。
郑芝龙亲书奏报：“顺化王朝虽称臣，日后变数难料。大明水师宜再添三千人、三十舰，建南洋远洋港一处，方可保通道不绝。”
朱由检批示：“准。水师不止护海，更护国运。”
话音刚落，户部尚未整理完报表，锦衣卫便紧急入宫，送来一封密信：
“福王朱常洵于河南私招义勇，自号‘中兴监国’，暗联江淮旧勋与部分宗室藩邸，图谋不轨，已被地方巡抚捕人。”
朱由检沉声道：“堂堂亲王，竟敢私招兵马，欺君犯上。”他随即下旨：
“魏忠贤、洪承畴即刻调军镇压，生擒福王。地方巡抚不力者，一并问责。”
仅五日，魏忠贤便拿下福王旧部据点三处，洪承畴亲率兵马围困福王私府，擒下朱常洵，解赴京师。
三天后，福王被贬为庶人，发配西北看守屯田，永不得返京。其余宗室参与者或削爵，或流放，或革职为民。
这次宗室叛乱虽小，却如惊雷一击，使朱由检彻底意识到，宗室若不束之以制，迟早再乱。
嘉平九年初，朱由检召集内阁、兵部、礼部、宗人府、户部五司共议“宗室整编之策”。
文华殿会议上，朱由检开门见山：“大明宗室分封百余，年支俸禄百万，兵权不清，商权不禁，今日福王谋反，只是前兆，朕要彻底清规。”
温体仁率先附议：“陛下之策合乎形势，当以国家安危为上。”
朱由检立三道铁令：藩王不得擅自招兵，违者以谋反论处；藩邸不得参与商业贸易、银庄放贷，宗室俸禄统一减半，非亲王一律从简供给。
一石激起千层浪，宗人府主事当场跪下：“陛下，此制太急，恐宗亲震动，激发怨气。”